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Nat. Commun. | 基于共價肽的溶酶體靶向蛋白降解平臺2025-02-21

分享一篇發表在Nature Communications上的文章,題目為“A covalent peptide-based lysosome-targeting protein degradation platform for cancer immunotherapy”,文章的通訊作者為中山大學藥學院(深圳)的高艷鋒教授和周秀曼研究員,他們主要從事腫瘤免疫與藥物化學的交叉領域研究。

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以溶酶體靶向嵌合體(LYTAC)為代表的膜蛋白降解技術為蛋白靶向降解(TPD)提供了強大的工具。然而,這些技術目前還存在一些短板。一方面,它們通常依賴抗體、納米抗體或核酸適配體等生物大分子靶向感興趣蛋白(POI),限制了它們的合成易得性和腫瘤穿透能力;另一方面,目前可用的膜表面受體有限,LYTACs通常通過聚糖配體招募溶酶體內吞受體(如ASGPR和M6PR),但它們易被內源配體占據,且難以循環回質膜。近期,云南農業大學周合江助理研究員/國家納米科學中心聶廣軍研究員聯合團隊報道了利用轉鐵蛋白受體TFRC作為一種新型的LYTAC效應器,其受天然配體影響小、回收效率高(Cell Chem Biol. 2024: S2451-9456(24)00520-8.)。然而,該工作仍使用抗體靶向POI;并使用天然的TFRC結合肽招募TFRC,使得其對效應器的親和力有限。
基于肽的靶向降解劑有效地克服了抗體綴合物的上述缺陷,此外,利用共價肽結合POI可以實現長效的占據,引入D型氨基酸更可賦予其更強的穩定性和超越天然配體的親和力。在本文中,作者提出了一種稱為基于共價嵌合肽的靶向降解平臺(Pep-TACs)的策略,其使用含有基于硫(VI)氟交換(SuFEx)反應的共價彈頭的D型肽配體共價結合POI,并通過偶聯的TFRC D型肽配體招募效應器,從而實現高效、穩健的膜蛋白溶酶體降解。
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首先,作者鎖定了TFRC作為效應器:在目前已知的主要溶酶體靶向受體(LTR)中,TFRC在多種腫瘤中高表達,且受細胞周圍環境影響較小、回收率較高。作為概念驗證,作者將已被報道的TFRC D型短肽配體DT7和PD-L1 D型短肽配體OPBP1(8-12)偶聯,確認了非共價嵌合肽對兩蛋白的親和力。盡管這種非共價肽能高效地介導TFRC依賴的內吞,但對POI的降解能力有限,作者推測這是由于非共價肽在POI上過短的駐留時間不足以使后者被轉移到溶酶體中。作者認為,向POI配體部分引入共價反應性基團可有效地改善這一問題。

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為了更好地與POI交聯,作者設計了一種非天然氨基酸,k-ASF (x),其在賴氨酸側鏈上負載芳基磺酰氟。作者分別將非共價肽OPBP1(8-12)部分的各殘基替換為x,構建了一系列Pep-TACs,結果表明v9x可高效、持久地誘導POI的降解。作者隨后通過TFRC敲除、共定位成像等實驗證明了這種降解作用依賴于TFRC介導的內吞作用。

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最后,作者分別在高IFN-γ的酸性腫瘤微環境、荷瘤小鼠模型上展示了Pep-TACs對PD-L1高效、穩健的降解能力。作者也發現Pep-TACs可穿透血腦屏障(BBB),在原位腦腫瘤模型中發揮降解、免疫刺激和腫瘤抑制功能。

總結而言,本文以TFRC作為溶酶體靶向蛋白降解的效應器,通過D型共價肽實現了長效的POI靶向和高親和力的效應器招募,實現了高效、穩健的POI降解。

本文作者:TYC
責任編輯:TZS
原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41467-025-56648-6
文章引用:10.1038/s41467-025-56648-6
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